MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces violaceusniger Tu 4113 plasmid pSTRVI01

Total Repeats: 5485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015951	CGG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007458
2	NC_015951	ACC	2	6	743	748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007458
3	NC_015951	CTG	2	6	751	756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007458
4	NC_015951	CTG	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007458
5	NC_015951	TGG	2	6	802	807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007458
6	NC_015951	GCG	2	6	1131	1136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007459
7	NC_015951	CCG	3	9	1183	1191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007459
8	NC_015951	GCT	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
9	NC_015951	GAA	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007459
10	NC_015951	GGA	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007459
11	NC_015951	CAGC	2	8	1308	1315	25 %	0 %	25 %	50 %	345007459
12	NC_015951	GC	3	6	1375	1380	0 %	0 %	50 %	50 %	345007459
13	NC_015951	CCA	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007459
14	NC_015951	AGC	2	6	1441	1446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007459
15	NC_015951	GCT	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
16	NC_015951	AGCA	2	8	1504	1511	50 %	0 %	25 %	25 %	345007459
17	NC_015951	GCG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007459
18	NC_015951	AGC	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007459
19	NC_015951	GCT	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
20	NC_015951	TCG	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007459
21	NC_015951	ACGC	2	8	1726	1733	25 %	0 %	25 %	50 %	345007460
22	NC_015951	CCGC	2	8	1771	1778	0 %	0 %	25 %	75 %	345007460
23	NC_015951	AGG	2	6	1780	1785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007460
24	NC_015951	CGG	2	6	1787	1792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007460
25	NC_015951	GCC	2	6	1845	1850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
26	NC_015951	GCC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
27	NC_015951	GCC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
28	NC_015951	ACC	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007460
29	NC_015951	CCG	2	6	2031	2036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007460
30	NC_015951	CG	3	6	2048	2053	0 %	0 %	50 %	50 %	345007460
31	NC_015951	CGACCC	2	12	2069	2080	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	345007460
32	NC_015951	GGCT	3	12	2128	2139	0 %	25 %	50 %	25 %	345007460
33	NC_015951	GTC	2	6	2370	2375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
34	NC_015951	GTC	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
35	NC_015951	AG	3	6	2505	2510	50 %	0 %	50 %	0 %	345007461
36	NC_015951	TCCGC	2	10	2587	2596	0 %	20 %	20 %	60 %	345007461
37	NC_015951	AG	3	6	2619	2624	50 %	0 %	50 %	0 %	345007461
38	NC_015951	CGA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007461
39	NC_015951	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007461
40	NC_015951	GAG	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007462
41	NC_015951	C	6	6	3319	3324	0 %	0 %	0 %	100 %	345007462
42	NC_015951	GCG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
43	NC_015951	CCTAGC	2	12	3372	3383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007462
44	NC_015951	TCG	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
45	NC_015951	TCT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007462
46	NC_015951	CCA	2	6	3467	3472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007462
47	NC_015951	GTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007462
48	NC_015951	GTC	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
49	NC_015951	CCG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007462
50	NC_015951	TCG	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007462
51	NC_015951	ACCG	2	8	3795	3802	25 %	0 %	25 %	50 %	345007462
52	NC_015951	TACC	2	8	3822	3829	25 %	25 %	0 %	50 %	345007462
53	NC_015951	CAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007462
54	NC_015951	ACC	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007462
55	NC_015951	CTGC	2	8	3886	3893	0 %	25 %	25 %	50 %	345007462
56	NC_015951	CGACCT	2	12	3921	3932	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007462
57	NC_015951	CGG	2	6	3951	3956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
58	NC_015951	GGC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
59	NC_015951	GTT	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007462
60	NC_015951	CGG	2	6	4089	4094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
61	NC_015951	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
62	NC_015951	GCG	2	6	4183	4188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
63	NC_015951	CGG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
64	NC_015951	TCA	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007462
65	NC_015951	CGG	2	6	4233	4238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
66	NC_015951	CGG	2	6	4269	4274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
67	NC_015951	GCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
68	NC_015951	GCG	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
69	NC_015951	CGG	2	6	4449	4454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007462
70	NC_015951	CAG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007462
71	NC_015951	GGTCA	2	10	4740	4749	20 %	20 %	40 %	20 %	345007463
72	NC_015951	GAG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007463
73	NC_015951	GAT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007463
74	NC_015951	GTC	2	6	4819	4824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007463
75	NC_015951	CGG	2	6	4944	4949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
76	NC_015951	CCGCGG	2	12	4982	4993	0 %	0 %	50 %	50 %	345007463
77	NC_015951	TTG	2	6	4994	4999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007463
78	NC_015951	GCG	3	9	5029	5037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
79	NC_015951	GCG	2	6	5051	5056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007463
80	NC_015951	GGCG	2	8	5061	5068	0 %	0 %	75 %	25 %	345007463
81	NC_015951	GCCA	2	8	5099	5106	25 %	0 %	25 %	50 %	345007463
82	NC_015951	CG	3	6	5140	5145	0 %	0 %	50 %	50 %	345007463
83	NC_015951	GGCG	2	8	5190	5197	0 %	0 %	75 %	25 %	345007463
84	NC_015951	CCA	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007463
85	NC_015951	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007464
86	NC_015951	TCG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007464
87	NC_015951	CAT	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007464
88	NC_015951	TGG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
89	NC_015951	ATG	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007464
90	NC_015951	GTC	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007464
91	NC_015951	CG	4	8	5678	5685	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
92	NC_015951	CGG	2	6	5757	5762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
93	NC_015951	AGG	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007464
94	NC_015951	GGTCGC	2	12	5843	5854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345007464
95	NC_015951	GGGT	2	8	5875	5882	0 %	25 %	75 %	0 %	345007464
96	NC_015951	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
97	NC_015951	AGT	2	6	6050	6055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007464
98	NC_015951	GTG	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
99	NC_015951	GGGC	2	8	6073	6080	0 %	0 %	75 %	25 %	345007464
100	NC_015951	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007464
101	NC_015951	CTT	2	6	6114	6119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007464
102	NC_015951	GGTGTA	2	12	6147	6158	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	345007464
103	NC_015951	GCGG	2	8	6159	6166	0 %	0 %	75 %	25 %	345007464
104	NC_015951	GC	3	6	6208	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
105	NC_015951	GCG	2	6	6232	6237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
106	NC_015951	GC	3	6	6253	6258	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
107	NC_015951	CGG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
108	NC_015951	GGC	3	9	6426	6434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
109	NC_015951	GCG	2	6	6440	6445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
110	NC_015951	GGC	2	6	6447	6452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
111	NC_015951	G	6	6	6453	6458	0 %	0 %	100 %	0 %	345007464
112	NC_015951	CGC	2	6	6518	6523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007464
113	NC_015951	GGGC	2	8	6536	6543	0 %	0 %	75 %	25 %	345007464
114	NC_015951	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
115	NC_015951	GCG	2	6	6622	6627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
116	NC_015951	GGTG	2	8	6636	6643	0 %	25 %	75 %	0 %	345007464
117	NC_015951	CAG	2	6	6669	6674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007464
118	NC_015951	CGG	2	6	6696	6701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
119	NC_015951	GTG	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007464
120	NC_015951	TCC	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007464
121	NC_015951	CCGA	2	8	6744	6751	25 %	0 %	25 %	50 %	345007464
122	NC_015951	GA	3	6	6781	6786	50 %	0 %	50 %	0 %	345007464
123	NC_015951	CGG	2	6	6788	6793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007464
124	NC_015951	GCCGCA	2	12	6797	6808	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007464
125	NC_015951	CGGC	2	8	6815	6822	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
126	NC_015951	GC	3	6	6831	6836	0 %	0 %	50 %	50 %	345007464
127	NC_015951	CAA	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007464
128	NC_015951	AGG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007465
129	NC_015951	GCG	2	6	7067	7072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
130	NC_015951	GCG	2	6	7091	7096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
131	NC_015951	GGC	2	6	7097	7102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
132	NC_015951	GTCG	2	8	7108	7115	0 %	25 %	50 %	25 %	345007465
133	NC_015951	CAG	2	6	7139	7144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007465
134	NC_015951	GGC	2	6	7157	7162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
135	NC_015951	GGC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
136	NC_015951	CGG	2	6	7277	7282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
137	NC_015951	CGT	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
138	NC_015951	TGG	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007465
139	NC_015951	GCT	2	6	7370	7375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
140	NC_015951	GCG	2	6	7386	7391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
141	NC_015951	GGC	2	6	7393	7398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007465
142	NC_015951	CGT	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
143	NC_015951	CGGC	2	8	7428	7435	0 %	0 %	50 %	50 %	345007465
144	NC_015951	GCC	3	9	7479	7487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007465
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150	NC_015951	CGT	2	6	7708	7713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007465
151	NC_015951	CCTC	2	8	7720	7727	0 %	25 %	0 %	75 %	345007465
152	NC_015951	TGGCC	2	10	7769	7778	0 %	20 %	40 %	40 %	345007465
153	NC_015951	GC	3	6	7933	7938	0 %	0 %	50 %	50 %	345007466
154	NC_015951	GGC	2	6	7943	7948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007466
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158	NC_015951	GTCCAG	2	12	8041	8052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007466
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160	NC_015951	GGTGA	2	10	8209	8218	20 %	20 %	60 %	0 %	345007466
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164	NC_015951	GTG	2	6	8447	8452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007466
165	NC_015951	GGT	2	6	8461	8466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007466
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170	NC_015951	CCT	2	6	8562	8567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007466
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180	NC_015951	TTC	2	6	9107	9112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007466
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224	NC_015951	CGACC	2	10	11039	11048	20 %	0 %	20 %	60 %	345007468
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239	NC_015951	CGG	2	6	12218	12223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007469
240	NC_015951	ACG	2	6	12228	12233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007469
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243	NC_015951	ACG	2	6	12437	12442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007469
244	NC_015951	CGGC	2	8	12470	12477	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
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246	NC_015951	GC	3	6	12505	12510	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
247	NC_015951	CGG	2	6	12556	12561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007469
248	NC_015951	CACC	2	8	12571	12578	25 %	0 %	0 %	75 %	345007469
249	NC_015951	CGAG	2	8	12639	12646	25 %	0 %	50 %	25 %	345007469
250	NC_015951	ATC	2	6	12722	12727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007469
251	NC_015951	CGT	2	6	12748	12753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007469
252	NC_015951	AACC	2	8	12762	12769	50 %	0 %	0 %	50 %	345007469
253	NC_015951	GCG	3	9	12786	12794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007469
254	NC_015951	CCAG	2	8	12810	12817	25 %	0 %	25 %	50 %	345007469
255	NC_015951	CG	3	6	12835	12840	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
256	NC_015951	CGA	2	6	12886	12891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007469
257	NC_015951	GC	3	6	12974	12979	0 %	0 %	50 %	50 %	345007469
258	NC_015951	CCA	2	6	13015	13020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007469
259	NC_015951	CGA	2	6	13024	13029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007469
260	NC_015951	GGT	2	6	13075	13080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007469
261	NC_015951	AGC	2	6	13107	13112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007469
262	NC_015951	GTC	2	6	13136	13141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007469
263	NC_015951	ACC	2	6	13197	13202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007469
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390	NC_015951	GCCG	2	8	20278	20285	0 %	0 %	50 %	50 %	345007477
391	NC_015951	CTC	2	6	20305	20310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007477
392	NC_015951	GCG	2	6	20313	20318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007477
393	NC_015951	TCC	2	6	20369	20374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007477
394	NC_015951	GA	3	6	20495	20500	50 %	0 %	50 %	0 %	345007478
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499	NC_015951	GAT	2	6	24747	24752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007482
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